З похолоданням же 80% води надходить у річку із кришталево чистих підземних джерел, тому її русло стає прозорим. А крихітні частинки зелених пісковиків і сланців у верхів'ях і середній течії Катуні забарвлюють її в дивовижно красивий колір.
У середній та верхній частині Катунь як би прорізає зеленокам'яну формацію пісковиків. Вони і дають річці бірюзовий відтінок. Найпрозоріша та бірюзова вода в Катуні буває взимку. Катунь єдина на Алтаї, а можливо й у всій Росії річка з незвичайним кольором.
Восени наприкінці вересня гірська річка Катунь, яка бере свій початок у льодовиках Геблера на висоті близько 2000 метрів над рівнем моря, стає Дивно бірюзового кольору, подивитися на це явище можна у Чемальському районі Гірського Алтаю.
Протягом року річка змінює свій колір: навесні і влітку танущі води льодовиків Алтаю забарвлює її в брудно-молочний колір, А ближче до осені вона стає більш прозорою, з бірюзовим відтінком у верхній та середній течії.